Hava Seyrüsefer Daire Başkanlığının faaliyetleri 3 Koordinatörlük altında yürütülmektedir. Bunlar;

• Haberleşme ve Hava Trafik Sistemleri Koordinatörlüğü
• Hava Trafik Yönetimi ve Lisanslandırma Koordinatörlüğü
• İHA Koordinatörlüğü

Hava Seyrüsefer Daire Başkanlığının faaliyetleri şunlardır:

• Sivil terminal ve kontrol sahaları, hava trafik hizmetleri ile ilgili hava sahası düzenleme çalışmaları yapmak, ilgili sivil ve askeri kurum ve mali takvimin uyumlu hale getirilmesini sağlamak.
• Hava trafik yönetimi düzenli, emniyetli, hızlı ve ekonomik bir şekilde büyümek için ilgili organizasyonlarla planlamalar yapılır, kural koyucu ve birlik sağlanır.
• Hava hadiselerini gözden geçirme, değerlendirme ve değerlendirme, bölgedeki ilgili kişi ve kurumlara gerekli uyarıları yapmak ve gerekli önlemleri alarak uykuyu sağlamak.
• Hava alanı kapasitesi ve kullanımı ile ilgili olarak ilgili kurum ve kuruluşlarla uyumlu bir şekilde NOTAM ve Havacılık Bilgi Yayını'nın yayımlanmasını veya yayımlanmasını sağlamak, bunun dışında kalan ayrıntılarda servis sağlayıcı kuruluşlar tarafından NOTAM ve Havacılık Bilgi Yayını'nın yayımlanması ile ilgili usul ve esasların belirlenmesi, gerekli düzenlemeleri yapmak ve yapılmaması almak.
• Hava trafik yönetimi ile ilgili ulusal ve uluslararası kurum, kuruluş ve teşkilatlarla çalışmak, ulusal mevzuat düzenlemeleri ile töreni sağlamak ve takip etmek.
• Havacılık iletişimini ve kayıtlarını takip etmek ve bu birliğin frekans koordinasyonunu sağlamak.
• Havacılık meteorolojisi ile ilgili çalışmaları koordine etmek, kazanmasını sağlamak.
• Sivil hava araçlarının kamu ve uçuş emniyeti ile hava seyrüsefer güvenliğinin uyması gereken düzenlemeleri yapmak, arızalar, hava trafik yönetim hizmetleriyle ilgili önlemler almak ve ilgili parçaların lisanslandırılma esaslarını belirlemek, takibini yapmak, yenilemek ve iptal etmek.
• Yasak, tahditli ve tehlikeli sahaların belirlenmesi aşamasında askeri ve sivil bölgelerdeki bölgesel operasyondur.
• Hava trafik personelinin sahip olması gereken eğitimin kapsamı ve dağıtılan ile hava trafik bölgelerine eğitim verecek özel eğitimlerin eğitim esaslarını belirler. 
• Genel Müdür tarafından verilecek benzer işlemler yapmak.